Wissenschaftliche Mitarbeiterin / Wissenschaftlicher Mitarbeiter / Postdoc (d/w/m) Computational Immunology Einsatzort: Campus Virchow-Klinikum, Wedding

Fachgebiet
Immunologie

Arbeitszeit
Vollzeit

Eintrittsdatum
15.01.2027

Dauer der Anstellung
Befristet

Bewerbungsfrist
11.12.2026

Einsatzort Charité
Campus Virchow-Klinikum, Wedding

Kennziffer
8577

Entgeltgruppe
E13

Arbeiten an der Charité

Der Fächerverbund für Infektiologie, Pneumologie und Intensivmedizin widmet sich der translationalen Erforschung von Infektions- und Lungenerkrankungen. Die Arbeitsgruppe Buchauer ist im Bereich der computergestützten Immunologie tätig und entwickelt Werkzeuge zur Analyse von Omics- und Durchflusszytometriedaten. Die Arbeitsgruppe Gröschel beschäftigt sich mit neuen Ansätzen zur Diagnostik, Therapie und Prognose der Tuberkulose sowie der Entwicklung und Evaluation von KI-Werkzeugen für die klinische Praxis. Unser junges und interdisziplinäres Team bietet eine abwechslungsreiche Tätigkeit mit zahlreichen Gestaltungs- und Entwicklungsmöglichkeiten in kollegialer Arbeitsatmosphäre.

Als Teil der in unserer Klinik angesiedelten DFG-Forschungsgruppe „Krankenhausassoziierte Infektionen – Aufklärung schützender und prädisponierender Faktoren zur Entwicklung neuartiger prophylaktischer Strategien (HAI)“ untersuchen die AG Sander, AG Gröschel und AG Buchauer die Rolle von T-Zellen bei nosokomialen Infektionen. Während die Rolle von T-Zellen bei viralen Erkrankungen recht gut verstanden ist, ist die Rolle von T-Zellen bei bakteriellen Infektionen – insbesondere beim Übergang von Besiedelung zu invasiver Infektion – weitgehend unklar. Im Rahmen des Projekts soll durch die Charakterisierung pathogen-reaktiver T-Zellen aus Patientenkohorten, inklusive Einzelzellsequenzierung und TCR-Sequenzierung sowie paralleler Pathogensequenzierung und bioinformatischer Analysen der Zusammenhang zwischen bestehender T-Zell-Immunität, bakteriellen Virulenzmarkern und der Entstehung nosokomialer Infektionen erforscht werden. Das Projekt verbindet Grundlagen- und angewandte Forschung und hat zum Ziel die Diagnostik und Prävention von krankenhausassoziierten Infektionen zu verbessern. Hierfür suchen wir eine wissenschaftliche Mitarbeiterin / einen wissenschaftlichen Mitarbeiter (Postdoc) zur Durchführung des Projekts und Analyse der erhobenen Daten.

Die Stelle im Überblick

• Sie verantworten sämtliche computationalen und bioinformatischen Analysen des Teilprojekts. Hierzu gehören:
  • Prozessierung und Analyse von Einzelzell-Sequenzierdaten
  • TCR-Repertoire-Analyse
  • Bakterielle Genomik (Ganzgenom- und Metagenomsequenzierung) und Within-Host-Evolution
  • Integrative statistische Modellierung von Wirts-, Pathogen- und klinischen Daten
• Sie entwickeln und erproben neuartige Rechenmethoden für TCR und Einzelzell-RNA-Daten
• Sie begleiten das Datenmanagement
• Sie wirken bei der Erstellung der Projektpublikationen mit und präsentieren die Projektergebnisse im Rahmen von Fachkonferenzen und projektinternen Veranstaltungen
• Sie werden als wissenschaftliche Mitarbeiterin / wissenschaftlicher Mitarbeiter beschäftigt: Nach §110 (4), Satz 3 sieht das BerlHG für wissenschaftliche Mitarbeitende eine angemessene Zeit innerhalb der Arbeitszeit für die eigene wissenschaftliche Weiterqualifikation vor

Danach suchen wir

• Sie verfügen über ein abgeschlossenes wissenschaftliches Hochschulstudium (Master, Diplom oder vergleichbar) in Bioinformatik, Computational Biology, Informatik, Physik, Mathematik, Statistik oder in den Lebenswissenschaften mit quantitativem Schwerpunkt, welches in Deutschland anerkannt ist (siehe auch anabin – https://anabin.kmk.org) und besitzen eine abgeschlossene Promotion in einem der genannten Fächer oder einem verwandten Fachgebiet
• Sie bringen fundierte Kenntnisse und praktische Erfahrung in mindestens einem der Bereiche Einzelzell-Omics-Analyse, Immunrepertoire-(TCR-)Analyse oder bakterielle Genomik sowie Bereitschaft, sich zügig in die jeweils anderen Bereiche einzuarbeiten ein
• Sie besitzen sehr gute Programmierkenntnisse in Python und/oder R; idealerweise haben Sie Erfahrung mit Linux, Hochleistungsrechnern (HPC), Versionskontrolle (Git) und Workflow-Management
• Sie verfügen über fundierte Kenntnisse in Statistik und maschinellem Lernen
• Grundkenntnisse in Immunologie und/oder Mikrobiologie sind von Vorteil
• Sie haben bereits Erfahrung im wissenschaftlichen Schreiben und Publizieren in internationalen Fachzeitschriften sammeln können
• Sie verfügen über Kenntnisse im Forschungsdatenmanagement (FAIR-Prinzipien) und im Umgang mit pseudonymisierten Patientendaten
• Sie können sehr gut schriftlich und mündlich auf Englisch kommunizieren. Deutschkenntnisse von Vorteil
• Sie besitzen die Fähigkeit zu selbstständiger, strukturierter und zielorientierter wissenschaftlicher Arbeit
• Sie können in interdisziplinären (klinischen, experimentellen und computationalen) Teams arbeiten
• Sie können sich selbst und andere organisieren und verfügen über ein ausgeprägtes Verantwortungsbewusstsein

Das bringt die Charité mit

• Eine hoch professionelle Zusammenarbeit in einem motivierten und interdisziplinären Team
• Eine zukunftsorientierte, abwechslungsreiche und anspruchsvolle Tätigkeit mit hoher Eigenverantwortung und persönlichem Handlungsspielraum
• Umfangreiche kostenfreie Fort- und Weiterbildungsmöglichkeiten
• Vergünstigungen bei vielen Angeboten für Beschäftigte für die Bereiche Shopping, Reisen, Sport
• Eine zusätzliche Absicherung im Alter durch unsere betriebliche Altersvorsorge
• Seit 2007 zertifiziert als familiengerechte Hochschule und familiengerechtes Unternehmen – Weitere Informationen finden Sie hier

Informationen zur Stelle

• Entgeltgruppe E13 TVöD-VKA. Hier finden Sie alle Informationen zum Gehalt und Tarifvertrag
• Vollzeitstelle mit 38,5 Wochenstunden, Teilzeit nach Absprache möglich
• Die Position ist projektgebunden bis zum 30.09.2030 befristet
• Die Bewerbungsfrist endet am 11.12.2026

• Kennziffer 8577

Bewerbung

An der Charité sind alle willkommen, unabhängig von Alter, Religion, Geschlecht, geschlechtlicher Identität, sexueller Orientierung, Nationalität, Behinderung, ethnischer oder sozialer Herkunft. Hier zählt jeder Mensch! Wir setzen uns für Chancengleichheit und Inklusion ein.

Aus Datenschutzgründen nehmen wir Bewerbungen ausschließlich über unser Bewerbungsportal entgegen. Der unten angegebene Kontakt steht ausschließlich für Rückfragen zur Verfügung.

Bei Fragen wenden Sie sich bitte an:

Prof. Dr. Lisa Buchauer

lisa.buchauer@charite.de

Vorteile und Leistungen

Faire Löhne und Arbeitskonditionen

An der Charité erwarten dich Tarifverträge mit fairem Gehalt, vielfältigen Zusatzleistungen und 30 Tagen Urlaub. Die aktuellen Tarifverträge und Entgelttabellen findest du hier.

Interdisziplinäres Arbeiten

Wir kooperieren mit anderen Kliniken weltweit und arbeiten auch im Alltag interdisziplinär zusammen. Unsere Arbeit ist geprägt von einem kontinuierlichen Austausch untereinander.

Stimulierendes Arbeitsumfeld

An der Charité arbeiten herausragende Kolleginnen und Kollegen. Ein optimales Umfeld für die eigene Weiterentwicklung.

Weitere Vorteile

Häufig gestellte Fragen

Kann ich Familie und Beruf an der Charité gut vereinen?

Die Charité ist bereits seit 2007 als familienfreundliches Unternehmen zertifiziert. Wir unterstützen Eltern bei regulärer und flexibler Kinderbetreuung, bei der Betreuung in Notfällen, bei Überstunden oder bei Krankheit des Kindes und während der Ferien. Weitere Informationen hierzu gibt es unter familie.charite.de.

Für Mitarbeitende der Gesundheitsfachberufe, die ihre Arbeitszeit verkürzen oder flexibel gestalten wollen, gibt es einen familienfreundlichen Pool.

Gibt es eine Impfpflicht an der Charité?

Das Masernschutzgesetz sieht vor, dass Beschäftigte in medizinischen Einrichtungen einen Masern-Impfschutz bzw. eine Immunität nachweisen. Dabei spielt es keine Rolle, ob sie in der Krankenversorgung oder hinter den Kulissen tätig sind.

Eine COVID-19-Impfung ist keine Einstellungsvoraussetzung.

Gibt es auch die Möglichkeit, in Teilzeit zu arbeiten?

Generell bieten wir immer auch die Möglichkeit, in Teilzeit zu arbeiten. Ob und in welcher Form besprichst du am besten direkt mit deiner Ansprechpartnerin oder Ansprechpartner.

Weitere Fragen und Antworten

Die Charité weist darauf hin, dass im Rahmen und zu Zwecken des Bewerbungsverfahrens an verschiedenen Stellen in der Charité (z.B. Fachbereich, Personalvertretung, Personalabteilung) personenbezogene Daten gespeichert und verarbeitet werden. Weiterhin können die Daten innerhalb des Konzerns sowie an Stellen außerhalb (z.B. Behörden) zur Wahrung berechtigter Interessen übermittelt bzw. verarbeitet werden. Mit Ihrer Bewerbung stimmen Sie unseren Datenschutz- und Nutzungsbestimmungen für Bewerbungsverfahren, die Sie hier finden, zu.

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