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Doktorandin / Doktorand (d/w/m) Gastroenterologie, Infektiologie und Rheumatologie Einsatzort: Campus Benjamin Franklin, Steglitz

Eckdaten

Hochschule
Charité
Website
charite.de ↗
Standort
Berlin
Stellenart
PhD / Doktorandenstelle
Anstellungsart
Teilzeit
Vergütung
E13 TVÖD
Befristung
Befristet
Bewerbungsfrist
31.05.2026
Fachgebiete
Bioinformatik, Biologie, Biotechnologie, Data Science, Humanmedizin, Hygiene und Mikrobiologie, Informatik, Innere Medizin

Doktorandin / Doktorand (d/w/m) Gastroenterologie, Infektiologie und Rheumatologie

Fachgebiet

Innere Medizin

Arbeitszeit

Teilzeit

Eintrittsdatum


01.08.2026

Dauer der Anstellung


Befristet

Bewerbungsfrist

31.05.2026

Einsatzort Charité

Campus Benjamin Franklin, Steglitz

Kennziffer

7189

Entgeltgruppe

E13

Arbeiten an der Charité

Unsere Arbeitsgruppe beschäftigt sich mit der molekularen Charakterisierung chronisch-entzündlicher Darmerkrankungen mit Fokus auf fistulierende Verläufe bei Morbus Crohn. Ziel ist es, krankheitsspezifische Zell-Zell-Interaktionen und molekulare Programme zu identifizieren und daraus neue therapeutische Ansätze abzuleiten.

Im Rahmen eines durch die Else Kröner-Fresenius-Stiftung geförderten Projekts werden modernste räumliche Multi-Omics-Technologien (metabolic Imaging Mass Cytometry und 10X 5K Spatial Transcriptomics) kombiniert, um die Pathogenese von Fisteln und deren Progression zu untersuchen. Ergänzend werden patientenabgeleitete intestinale Assembloid-Modelle etabliert, um funktionelle Mechanismen zu validieren.

Zusätzlich besteht die Möglichkeit, an einem Projekt zur molekularen Charakterisierung von Fistel-assoziierten Karzinomen mitzuwirken. Wir bieten Ihnen ein hochmodernes translationales Forschungsumfeld mit Zugang zu Core Facilities, die enge Einbindung in nationale und internationale Kollaborationen (u. a. CRC-TRR241/ IBDome), eine strukturierte wissenschaftliche Betreuung sowie die Mitarbeit in einem interdisziplinären und internationalen Team.

Die Stelle im Überblick

  • Etablierung und Weiterentwicklung einer multimodalen Analysepipeline für Metabolic Imaging Mass Cytometry (IMC / mIMC) und Spatial Transcriptomics (10x Xenium 5K)
  • Integration und Analyse multimodaler Datensätze (Protein + Transkriptom + Spatial Data)
  • Bioinformatische Auswertung (z. B. R-basierte Pipelines, SingleCell-Analysen, Integrationsmethoden)
  • Analyse von Zell-Zell-Interaktionen und molekularen Netzwerken bei fistulierendem Morbus Crohn
  • Mitarbeit an der Etablierung und Analyse humaner intestinaler Assembloide
  • Funktionelle Validierung identifizierter molekularer Kandidaten
  • Unterstützung bei der Gewinnung, Aufarbeitung und Dokumentation von Patientenproben (Biopsien, Resektate)
  • Enge Zusammenarbeit mit klinischen Partnern, Core Facilities und Bioinformatik
  • Präsentation der Ergebnisse auf Konferenzen und in Lab-Meetings
  • Verfassen wissenschaftlicher Publikationen
  • Wissenschaftlichen Mitarbeitenden wird nach § 110 (4), Satz 3 BerlHG eine angemessene Zeit innerhalb der Arbeitszeit für die eigene wissenschaftliche Weiterqualifikation zur Verfügung gestellt

Danach suchen wir

  • Abgeschlossenes Masterstudium in Biologie, Biotechnologie, Bioinformatik oder verwandten Lebenswissenschaften
  • Interesse an translationaler Forschung und humanen Krankheitsmodellen
  • Erfahrungen in Einzelzell- oder Spatial-Omics, Bioinformatik / Datenanalyse (R, Python), Zellkultur / Organoide / Assembloids oder Immunologie / Molekularbiologie vorteilhaft
  • Motivation, eigenständig und im Team zu arbeiten
  • Strukturierte und sorgfältige Arbeitsweise
  • Sehr gute Englischkenntnisse

Das bringt die Charité mit

  • Mitarbeit in einem innovativen, translationalen Forschungsprojekt mit hoher klinischer Relevanz
  • Zugang zu einzigartigen Patientenkohorten und Biobank-Daten
  • Ausbildung an modernsten Technologien (Spatial Omics, Multi-Modal Data Integration)
  • Möglichkeit zur wissenschaftlichen Weiterentwicklung und Publikation in hochrangigen Journals
  • Einbindung in strukturierte Graduiertenprogramme

Informationen zur Stelle

  • Entgeltgruppe E13 TVöD VKA-K. Hier finden Sie alle Informationen zum Gehalt und Tarifvertrag
  • Arbeitszeit ist in Teilzeit mit 25,03 Wochenstunden
  • Die Position ist bis zum 31.07.2029 befristet, da sie an die Projektlaufzeit gebunden ist
  • Bei uns sind 30 Tage Urlaub Standard
  • Die Bewerbungsfrist endet am: 31.05.2026
  • Kennziffer: 7189

Bewerbung

An der Charité sind alle willkommen, unabhängig von Alter, Religion, Geschlecht, geschlechtlicher Identität, sexueller Orientierung, Nationalität, Behinderung, ethnischer oder sozialer Herkunft. Hier zählt jeder Mensch! Wir setzen uns für Chancengleichheit und Inklusion ein.

Aus Datenschutzgründen nehmen wir Bewerbungen ausschließlich über unser Bewerbungsportal entgegen. Der unten angegebene Kontakt steht ausschließlich für Rückfragen zur Verfügung.

Bei Fragen wenden Sie sich bitte an:

Dr. med. Malte Lehmann

malte.lehmann@charite.de

Vorteile und Leistungen

Faire Löhne und Arbeitskonditionen

An der Charité erwarten dich Tarifverträge mit fairem Gehalt, vielfältigen Zusatzleistungen und 30 Tagen Urlaub. Die aktuellen Tarifverträge und Entgelttabellen findest du hier

Interdisziplinäres Arbeiten

Wir kooperieren mit anderen Kliniken weltweit und arbeiten auch im Alltag interdisziplinär zusammen. Unsere Arbeit ist geprägt von einem kontinuierlichen Austausch untereinander. 

Stimulierendes Arbeitsumfeld

An der Charité arbeiten herausragende Kolleginnen und Kollegen. Ein optimales Umfeld für die eigene Weiterentwicklung. 

Weitere Vorteile

Häufig gestellte Fragen

Kann ich Familie und Beruf an der Charité gut vereinen?

Die Charité ist bereits seit 2007 als familienfreundliches Unternehmen zertifiziert. Wir unterstützen Eltern bei regulärer und flexibler Kinderbetreuung, bei der Betreuung in Notfällen, bei Überstunden oder bei Krankheit des Kindes und während der Ferien. Weitere Informationen hierzu gibt es unter familie.charite.de.

Für Mitarbeitende der Gesundheitsfachberufe, die ihre Arbeitszeit verkürzen oder flexibel gestalten wollen, gibt es einen familienfreundlichen Pool

Gibt es eine Impfpflicht an der Charité?

Das Masernschutzgesetz sieht vor, dass Beschäftigte in medizinischen Einrichtungen einen Masern-Impfschutz bzw. eine Immunität nachweisen. Dabei spielt es keine Rolle, ob sie in der Krankenversorgung oder hinter den Kulissen tätig sind.

Eine COVID-19-Impfung ist keine Einstellungsvoraussetzung.

Gibt es auch die Möglichkeit, in Teilzeit zu arbeiten?

Generell bieten wir immer auch die Möglichkeit, in Teilzeit zu arbeiten. Ob und in welcher Form besprichst du am besten direkt mit deiner Ansprechpartnerin oder Ansprechpartner.


Weitere Fragen und Antworten

Die Charité weist darauf hin, dass im Rahmen und zu Zwecken des Bewerbungsverfahrens an verschiedenen Stellen in der Charité (z.B. Fachbereich, Personalvertretung, Personalabteilung) personenbezogene Daten gespeichert und verarbeitet werden. Weiterhin können die Daten innerhalb des Konzerns sowie an Stellen außerhalb (z.B. Behörden) zur Wahrung berechtigter Interessen übermittelt bzw. verarbeitet werden. Mit Ihrer Bewerbung stimmen Sie unseren Datenschutz- und Nutzungsbestimmungen für Bewerbungsverfahren, die Sie hier finden, zu.

Zusatzinformationen

Um dich für diesen Job zu bewerben, besuche bitte karriere.charite.de.

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